1. 毕业设计(论文)主要内容:
在生物体中,生物机能是通过体内的各种物质相互作用来实现的。如果以生物体内部的各种物质作为研究对象,它们的相互作用就构成了一个非常复杂的网络结构。要研究生物机能的实现过程,设计药物对生理过程进行干预,必须对复杂的生物网络进行数学建模。本题目以生物网络的建模方法作为研究对象,探讨如何利用生物实验数据进行复杂生物网络的建模和优化。研究内容主要包括以下几个方面:
1、了解生物信息学中的复杂网络
2、了解国内外对生物信息学中复杂网络的建模和推断的方法及其优缺点
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2. 毕业设计(论文)主要任务及要求
1、查阅不少于15篇的相关资料,其中英文文献不少于3篇,完成开题报告。
2、完成不少于5000字的英文文献翻译工作。
3、整理相关的研究成果,并进行改进创新的工作。
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3. 毕业设计(论文)完成任务的计划与安排
1-3周:查阅文献,完成开题报告4-6周:总体设计,完成论文综述7-10周:设计算法,功能模块设计11-13周:编码和测试14-15周:写论文,提交初稿,给老师检查,修改定稿,答辩。
4. 主要参考文献
1、沈威,基于微分方程模型构建基因调控网络研究(D),吉林大学博士论文,2012.
2、张秀君,基于互信息的基因调控网络构建方法研究(D),上海大学博士论文,2014.
3、L. Palafox et al., Reverse engineering of gene regulatory networks using dissipative particle swarm optimization. IEEE Transactions on Evolutionary Computation, vol. 17, no. 4, 577-587, 2013.
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