细菌基因组数据挖掘：一类抗生素靶点鉴定技术开发任务书

 2021-10-21 17:20:16

1. 毕业设计（论文）的内容和要求

1. 解析链霉菌基因组中的基因簇，收集多种基因表达（如全基因组突变）数据。

2. 利用抗性基因数据库、抗生素耐药性相关数据库等，应用比较基因组学工具筛查链霉菌中的抗性基因3. 评估抗生素靶点预测效果。

2. 参考文献

1. 石诚、孙影、肖斌、郑珩, 利用基因组数据挖掘发现新抗生素的研究。

药学学报，2018. 53: p845-8512. Wei, Z., et al., ARGA, a pipeline for primer evaluation on antibiotic resistance genes. Environ Int, 2019. 128: p. 137-145.3. Peng, Z.X., et al., [Antimicrobial susceptibility and drug-resistance genes of Yersinia spp. of retailed poultry in 4 provinces of China]. Zhonghua Yu Fang Yi Xue Za Zhi, 2018. 52(4): p. 358-363.4. Liu, B. and M. Pop, ARDB--Antibiotic Resistance Genes Database. Nucleic Acids Res, 2009. 37(Database issue): p. D443-7.5. Jia, B., et al., CARD 2017: expansion and model-centric curation of the comprehensive antibiotic resistance database. Nucleic Acids Res, 2017. 45(D1): p. D566-D573.6. Parisi, A., et al., Identification of virulence and antibiotic resistance factors in Arcobacter butzleri isolated from bovine milk by Whole Genome Sequencing. Ital J Food Saf, 2019. 8(2): p. 7840.7. 陈敏捷，王广华，戴世鲲，谢练武，李翔，链霉菌聚酮类次生代谢产物及其生物合成基因簇。

微生物学报 2009. 49: p1555-1563

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