生物医疗领域蛋白质-蛋白质关系抽取研究任务书

 2022-01-04 20:29:16

全文总字数:1599字

1. 毕业设计(论文)主要内容:

蛋白质关系抽取是生物医学信息抽取领域的重要分支。

研究蛋白质相互作用关系,对于探究生物进程存在的分子体制、分析机体细胞的生命活动具有重要的基础研究意义,进而用以分析疾病的起因,提出针对性的预防和治疗手段。

因此如何高效而又准确地从生物医学文本中抽取蛋白质关系(Protein-Protein Interaction , PPI)成为医学领域文本挖掘的主要任务之一,具有重要的研究意义。

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2. 毕业设计(论文)主要任务及要求

主要任务:

1. 了解关系抽取基本流程;

2. 掌握蛋白质-蛋白质关系抽取模型的实现方法;

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3. 毕业设计(论文)完成任务的计划与安排

(1)2020/1/13—2020/2/28:确定选题,查阅文献,外文翻译和撰写开题报告;

(2)2020/3/1—2020/4/30:系统架构、程序设计与开发、系统测试与完善;

(3)2020/5/1—2020/5/25:撰写及修改毕业论文;

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4. 主要参考文献

[1]李丽双,刘洋,黄德根.基于组合核的蛋白质交互关系抽取[J].中文信息学报,2013,27(1):86-93

[2]Li L, Zhang P, Zeng T, et al . Intergrating semanticinformation into multiple kernels for protein-protein interaction extractionfrom biomedical literatures[J] Plos one ,2014, 9(3):28-47

[3]Jiang Z, Li L, Huang D, et al. Training word embeddings fordeep learning in biomedical text mining tasks[C]//Proceeding of 2015 IEEEInternational Conference on Bioinformatics and Biomedicine.2015: 625-628.

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