全文总字数:2980字
1. 毕业设计(论文)的内容和要求
一、论文内容:一段20个氨基酸组成的人工蛋白存在20100种组合可能,现存天然蛋白仅取样了其中一小部分从头合成人工蛋白具有远超天然蛋白的多样性。
同时,没有进化序列的从头合成人工蛋白,与仅具有固定功能的天然蛋白相比,其清晰规整的结构更适合可以在有限的范围内做出对人类有益的调整。
因此,从头合成人工蛋白逐渐成为合成生物学领域热点研究方向。
2. 实验内容和要求
1. 以SynF4为平台进行从头合成人工单白文库的设计与构建。
掌握蛋白质定点突变、理性和半理性设计原则,确定本实验目标突变模式。
掌握基因克隆、连接相关设计与操作,学会构建高质量高容量的蛋白质文库。
3. 参考文献
1. Beasley JR, Hecht MH: Protein design: the choice of de novo sequences. J Biol Chem 1997, 272:2031-2034 http://dx.doi.org/ 10.1074/jbc.272.4.2031.2. Haber E, Anfinsen CB: Side-chain interactions governing the pairing of half-cystine residues in ribonuclease. J Biol Chem 1962, 237:1839-1844.3. Gutte B, Merrifield R: Total synthesis of an enzyme with ribonuclease a activity. J Am Chem Soc 1969, 91:501-502 http:// dx.doi.org/10.1021/ja01030a050.4. Regan L, Degrado W: Characterization of a helical protein designed from 1st principles. Science 1988, 241:976-978 http:// dx.doi.org/10.1126/science.3043666.5. Hecht M, Richardson J, Richardson D, Ogden R: De novo design, expression, and characterization of felix: a four-helix bundle protein of native-like sequence. Science 1990, 249:884-891 http://dx.doi.org/10.1126/science.2392678.6. Dahiyat B, Mayo S: De novo protein design: fully automated sequence selection. Science 1997, 278:82-87 http://dx.doi.org/ 10.1126/science.278.5335.82.7. Kuhlman B, Dantas G, Ireton G, Varani G, Stoddard B, Baker D: Design of a novel globular protein fold with atomic-level accuracy. Science 2003, 302:1364-1368 http://dx.doi.org/ 10.1126/science.1089427.8. Koga N, Tatsumi-Koga R, Liu G, Xiao R, Acton TB, Montelione GT, Baker D: Principles for designing ideal protein structures. Nature 2012, 491:222-227 http://dx.doi.org/10.1038/nature11600.9. Lin Y, Koga N, Tatsumi-Koga R, Liu G, Clouser AF, Montelione GT, Baker D: Control over overall shape and size in de novo designed proteins. Proc Natl Acad Sci U S A 2015, 112:E5478- E5485 http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1509508112.
4. 毕业设计(论文)计划
起讫日期 设计(论文)各阶段工作内容2020.12.12-12.18 选题,与导师讨论题目2020.12.31 导师下达任务书2020.12.31-2021.1.10 根据任务书要求,查找相关文献资料,完成任务书2021.01.11-2021.01.23 提交开题报告2021.01.23-05.23 完成试验并提交论文第一稿2021.05.24-05.27 根据导师意见修改论文第一稿,完成并提交第二稿2021.05.28-06.1 根据导师意见修改论文第二稿,完成并提交第三稿2021.06.1-06.7 完成论文的审阅,准备答辩
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