Bioperl分析环境构建及浙江红山茶DFR基因的生物信息学分析任务书

 2022-07-05 20:55:05

1. 1. 毕业设计(论文)的内容、要求、设计方案、规划等

一、 前言

到目前为止参与黄酮类化合物合成的大部分酶的基因以及它们的功能已在许多物种中得到克隆和验证。苯丙氨酸解氨酶(PAL)是连接初生代谢与次生代谢途经的纽带,所以也是研究较多的类黄酮合成酶类之一。查尔酮合成酶(CHS)是接黄酮合成途径中的第一个关键酶,将苯丙烷代谢途径引向黄酮类化合物的合成,是类黄酮合成途径中研究最清楚的酶类之一。查尔酮异构酶(CHI)是催化类黄酮合成途径的第二个反应步骤,催化查尔酮形成柚皮素。

本研究对不同林木中查尔酮合成酶(Chalcone synthane,CHS,EC 2.3.1.74), 苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanin-Ammonia-Lyase,PAL,EC 4.3.1.24),查尔酮异构酶(Chalcone Isomerase ,CHI, EC:5.5.1.6)基因及相应氨基酸序列的理化性质,结构特征,生物功能及系统进化关系等进行预测和分析,以期为今后深入研究 CHS,CHI和PAL家族蛋白的生化特性和类黄酮生物合成的分子机理提供理论依据!

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2. 参考文献(不低于12篇)

[1] 蒋明, 曹家树. 查尔酮合成酶基因[J]. 细胞生物学杂志, 2007, 29(4): 525-529.

[2] 张成岗,贺福初. 生物信息学方法与实践[M].北京: 科学出版社,2002:25-27

[3] 原晓龙, 周军, 辛培尧, 等. 8 种植物 CHI 基因的生物信息学分析[J]. 西南林业大学学报, 2013, 2: 019.

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