马尾松与黄山松EST-SSR引物设计与PCR反应体系优化任务书

 2022-07-05 21:02:39

1. 毕业设计(论文)的内容、要求、设计方案、规划等

1.前言通过查阅文献,了解查找EST及SSR、设计引物的基本方法,结合已学习的分子生物学、生物信息学、数理统计等课程知识,掌握PCR条件优化试验设计及操作流程,以此筛选出理想的引物组合及PCR条件,为后续了解马尾松与黄山松的种间生殖隔离遗传机制做好实验基础。

2.方案拟定①通过生物信息公共数据库(NCBI)查找松属EST序列,搜索SSR位点,分析SSR信息;②设计引物;③引物性能检测,即对引物进行马尾松、黄山松与杂交松通用性筛选;④引物性能分析;⑤设计并优化PCR条件。

进度计划:2014年2月及之前:阅读文献,掌握分子生物实验操作规程、熟练操作数据库检索和引物设计软件;3月:查找EST序列,搜索SSR位点,设计引物;4月:引物性能检测、分析,设计、优化PCR条件;5月:数据处理,论文撰写、修改、定稿;6月:论文答辩。

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2. 参考文献(不低于12篇)

[1] 季春峰, 邹惠渝, 向其柏. 黄山松研究进展[J]. 安徽农业大学学报, 2004, 1: 111-114.

[2] 曹牧. 马尾松遗传图谱的初步构建[D]. 南京林业大学, 2009.

[3] 李炟. 马尾松SSR引物开发[D]. 南京林业大学, 2007.

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