水生植物莲WRKY家族基因的分离和进化分析任务书

 2021-08-20 22:43:42

1. 毕业设计(论文)主要内容:

WRKY转录因子在植物中广泛存在,并且它们可以调控多种代谢过程(包括多种次生代谢物合成调控方面)。但是,目前WRKY调节次生代谢物的研究集中在陆生植物,基本没有涉及到水生植物。人们对水生植物如莲中WRKY的研究仍是空白。本课题运用生物信息学手段对莲中WRKY转录因子进行了初步的分析,分离莲的WRKY家族基因,并对其进行分类和进化分析。

2. 毕业设计(论文)主要任务及要求

1. 查阅不少于15篇的相关资料,其中英文文献不少于4篇,完成开题报告。

2. 以拟南芥和水稻等作物的WRKY基因序列为模板,对莲的基因组数据库进行BLAST分析。通过进一步的比对(alignment)和功能域(domain)分析,对候选基因进行进一步筛选;

3. 聚类分析:通过进化树分析,对莲WRKY家族基因进行分类;

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3. 毕业设计(论文)完成任务的计划与安排

第1-2周:查阅文献,准备开题。

第3周:完成毕业论文开题报告,确定实验技术路线。

第4-14周:实验,结果分析,继续查阅文献,撰写论文,导师审阅,定稿。

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4. 主要参考文献

1. David R. Nelson Mary A. Schuler. Cytochrome P450 Genes from the Sacred Lotus Genome (2013). Tropical Plant Biology 6:138–151.

2. Paul J. Rushton, Imre E. Somssich, Patricia Ringlerand Qingxi J. Shen. WRKY transcription factors (2010). Trends in Plant Science 15:1360-1385.

3.朱红霞,胡利宗,邓小莉,蔺芳. 大豆SBP基因家族的序列特征表达及进化分析 (2012). 东北农业大学学报 第43卷 第7期。

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