WRKY基因家族序列在植物中的进化分析任务书

 2021-09-01 21:55:52

1. 毕业设计(论文)主要内容:

WRKY转录因子在植物中广泛存在,是一类参与多种胁迫反应的诱导型转录因子,其N-端具有 WRKYGQK高度保守的氨基酸序列,能够与基因启动子中的(T)(T)TGAC(C/T)序列(W 盒)发生特异性结合,从而调节基因的表达,参与植物的各种生长发育以及多种代谢过程(包括多种次生代谢物合成调控方面)。

近些年来,有关WRKY转录因子的研究很多,人们在模式植物拟南芥中已经发现了74个WRKY成员;植物水稻基因组至少含有 102 个 WRKY 成员;葡萄中也发现了59个WRKY成员。

目前WRKY基因调节生长发育、次生代谢以及抗逆的研究主要集中在陆生植物,基本没有涉及到水生植物。

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2. 毕业设计(论文)主要任务及要求

1. 查阅不少于15篇的相关资料,其中英文文献不少于4篇,完成开题报告。

2. 以藤本植物葡萄的WRKY基因序列为模板,对莲的基因组数据库进行BLAST分析。

通过进一步的比对(alignment)和功能域(domain)分析,对候选基因进行进一步筛选;

3. 聚类分析:通过进化树分析,对莲WRKY家族基因进行分类;

4. 进化分析:莲是相对古老的草本植物,通过和藤本植物葡萄进行对比,对莲WRKY家族基因的进化特性进行分析。

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3. 毕业设计(论文)完成任务的计划与安排

第1-2周:查阅文献,准备开题。

第3周:完成毕业论文开题报告,确定实验技术路线。

第4-14周:实验,结果分析,继续查阅文献,撰写论文,导师审阅,定稿。

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4. 主要参考文献

1. Guo C, Guo R, Xu X, Gao M, Li X, Song J, Zheng Y, Wang X. Evolution and expression analysis of the grape (Vitis vinifera L.) WRKY gene family(2014). J Exp Bot. 65(6):1513-28.

2. Paul J. Rushton, Imre E. Somssich, Patricia Ringlerand Qingxi J. Shen. WRKY transcription factors (2010). Trends in Plant Science 15:1360-1385.

3.贾翠玲,侯和胜,葡萄WRKY基因超家族的进化分析。

硕士学位论文

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