玉米紫色酸性磷酸酶基因家族的生物信息学分析任务书

 2023-02-25 11:59:34

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

1. 掌握植物基因家族成员的鉴定、染色体分布和复制事件、系统发育、基因结构和保守基序、基因表达分析等方法。

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2. 实验内容和要求

1.玉米中PAP基因的系统鉴定。通过关键词搜索、BLAST比对等手段鉴定出玉米中PAP家族所有成员;

2.基因复制和系统发育分析。通过分析PAP基因的复制事件和系统发育关系,明确该家族的进化历史与机制;

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3. 参考文献

[1] Wang L S, Li Z, Qian W Q, et al. The Arabidopsispurple acid phosphatase AtPAP10 is predominantly associted with the root surface and plays an important role in plant tolerance to hosphate limitation [J]. Plant Physiol., 2011, 157(3): 1283-1299.

[2] Whitney D, JoonhoP, Hue T, et al. The secreted purple acid phosphatase isozymes AtPAP12 and AtPAP26 play a pivotal role in extracellular phosphate scavenging by Arabidopsis thaliana[J]. J. Exp. Bot., 2012, 63(18): 6531–6542.

[3] Zhang Q, Wang C, Tian J, et al. Identification of rice purple acid phosphatases related to phosphate starvation signaling [J]. Plant Mol. Biol., 2011, 13(1): 7-15.

4. 毕业设计(论文)计划

2022年11月-2019年12月,查阅相关文献,熟悉各种生物信息学数据库和软件;

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