GT类转录因子在植物中的亲缘关系分析任务书

 2023-04-11 10:44:42

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

通过对水稻中GT类转录因子的基因组学进化分析,以及其在其他三种模式植物拟南芥,段炳草,高粱中的综合分析,从而了解其保守结构域,分析其在GT类转录因子在染色体上的复制情况,以及其在水稻不同物种中的表达情况,从而最终为这些基因在植物中的功能解析提供借鉴。

2. 实验内容和要求

内容是综合分析水稻以及其他四种模式植物中HSF类转录因子的进化等分子生物学和基因组学研究。 GT类转录因子构成一个植物特有的转录因子家族与DNA结合结构域结合GT的元素。这一类型的DNA结合GT因子富含碱性和酸性氨基酸和脯氨酸和谷氨酰胺残基的DNA结合结构域,表现为一个典型trihelix(螺旋-环-螺旋-环-螺旋)结构,它决定了具体的GT元素的结合,因此GT的因素也被称为trihelix转录因子。我怕,我们的研究将重点分析GT类转录因子在植物中,尤其是模式植物水稻,拟南芥和段炳草中的亲缘进化关系。这一工作将为未来植物中基因的深入研究奠定基础。

要求:1:明确GT类转录因子在水稻中的进化分析

2:GT类转录因子在四种不同物种中的进化情况

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3. 参考文献

1. Kaplan-Levy RN, Brewer PB, Quon T, Smyth DR: The trihelix family of transcription factors--light, stress and development. Trends Plant Sci 2012, 17(3):163-171.

2. Fang Y, Xie K, Hou X, Hu H, Xiong L: Systematic analysis of GT factor family of rice reveals a novel subfamily involved in stress responses. Mol Genet Genomics 2010, 283(2):157-169.

3. Luo JL, Zhao N, Lu CM: [Plant Trihelix transcription factors family]. Yi Chuan 2012, 34(12):1551-1560.

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4. 毕业设计(论文)计划

3月底以前完成GT类转录因子的生物信息学以及基因组学分析

4月1号-4月30号以前完成毕业论文的写作

5月份完成毕业论文答辩

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