Dof类转录因子家族在水稻和拟南芥中的进化分析任务书

 2023-04-11 10:44:44

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

通过对水稻中DOF类转录因子的基因组学进化分析,以及其在其他三种模式植物拟南芥,段炳草,高粱中的综合分析,从而了解其保守结构域,分析其在DOF类基因家族在染色体上的复制情况,以及其在水稻不同物种中的表达情况,从而最终为这些基因在植物中的功能解析提供借鉴

2. 实验内容和要求

内容是综合分析水稻以及其他四种模式植物中HSF类转录因子的进化等分子生物学和基因组学研究。 Dof(DNA结合的一个锌指指纹结构)家族,其特异性结合到DNA序列的锌指结构,它的主要特征是含有50个氨基酸残基的C2-C2指结构,其关联到一个基本区域的保守区的锌指结构域的转录因子的5-T/AAAAG-3的核心。Dof类蛋白已被报道参与基因表达的诸如种子贮藏蛋白的合成在胚乳,涉及碳水化合物代谢的基因的光调节过程,植物防御机制,种子萌发,后期发芽,糊粉,生长素赤霉素响应反应和气孔保卫细胞特异性基因调控。目前,对于Dof家族的研究尽管已经有一些报道,但是对于其在植物中,尤其是两种模式植物中的进化亲缘关系却鲜有报道,我们的研究详细的分析了Dof类转录因子,以及其在整个进化上的关系。通过我们的研究,将为未来Dof转录因子在植物中的深入分析奠定基础。

要求:1:明确DOF类转录因子在水稻中的进化分析

2:DOF类转录因子在四种不同物种中的进化情况

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3. 参考文献

1. Kurai T, Wakayama M, Abiko T, Yanagisawa S, Aoki N, Ohsugi R: Introduction of the ZmDof1 gene into rice enhances carbon and nitrogen assimilation under low-nitrogen conditions. Plant Biotechnol J 2011, 9(8):826-837.

2. Le Hir R, Bellini C: The plant-specific dof transcription factors family: new players involved in vascular system development and functioning in Arabidopsis. Front Plant Sci 2013, 4:164.

3. Cai X, Zhang Y, Zhang C, Zhang T, Hu T, Ye J, Zhang J, Wang T, Li H, Ye Z: Genome-wide analysis of plant-specific Dof transcription factor family in tomato. J Integr Plant Biol 2013, 55(6):552-566.

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4. 毕业设计(论文)计划

3月底以前完成DOF转录因子家族的生物信息学以及基因组学分析

4月1号-4月30号以前完成毕业论文的写作

5月份完成毕业论文答辩

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