水稻WRKY基因家族在植物中的进化分析任务书

 2023-05-15 09:29:52

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

本课题从分子水平研究,通过对水稻全基因组分析WRKY基因,以期得到较为完整的WRKY基因家族,为WRKY基因的功能研究打下基础;通过水稻与短柄草、高粱、玉米WRKY基因组重复比对,得出基因家族的异同,可以得到WRKY基因家族在进化的关系,通过与其他物种WRKY基因的比较,更进一步明确水稻WRKY基因家族在植物中的起源与进化。

2. 实验内容和要求

内容:对水稻基因组(水稻精细图谱)作较为系统完整的WRKY基因家族数据分析;水稻与短柄草、高粱、玉米WRKY基因组重复比对,结合比较基因组以及生物信息学分析研究方法,研究WRKY基因家族在植物中的起源与进化。

要求:WRKY基因家族在水稻中有100 多个成员,其功能域或保守域被看作为进化的单位, 域的编码序列可以被复制或重组。基于这些结果,研究时要找到含有一个WRKY域的WRKY基因,根据数据,蒋水稻与短柄草、高粱、玉米WRKY基因组序列重复比对,并对水稻WRKY基因测序、染色体定位,对水稻WRKY基因motif 分析,最后根据结果来确定。本课题对WRKY-RICE基因重复比对数据的要求十分严格。

3. 参考文献

[ 1 ]ISHIGURO S , NAKAM URA K .Characterization of a cDNA encoding a novel DNA-binding protein , SPF1 , that recognizes S P8 sequences in the 5-upstream region s of genes coding for sporamin and β-amylase from sweet pot at o[ J] .Mo l.Gen .Genet , 1994 , 244(6):563 -571.

[ 2 ]XIE Z , ZHA NG Z L, ZOU X L, H UANG J , RUAS P , T HOMPSON D ,SH EN Q J .Annot at ions and functional analyses of the rice WRKY gene super family reveal positive and negative regulators of abscisic acid signaling in aleurone cells[ J] .Plant Physiol ., 2005 , 137(1):176-189.

[ 3 ]E ULGEM T , RUSH TON P J , ROBATZEK S , SOMSS ICH I E .T he WRKY super family of pl an t transcription factors[ J] .Trend s Plant S ci ., 2000 , 5(5):199 -206.

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4. 毕业设计(论文)计划

4.104.15 完成任务书;

4.164.17 策划毕业论文;

4.184.19 完成数据统计与分析;

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