1. 毕业设计（论文）的内容和要求
1.掌握植物基因家族成员的鉴定、系统发育和表达分析方法。
2.鉴定出玉米和拟南芥基因组中的RIO基因，明确其进化历史与机制，及在不同组织器官中的表达情况。
2. 实验内容和要求
1. 玉米和拟南芥RIO基因的系统鉴定。通过关键词搜索、BLAST比对等手段鉴定出玉米和拟南芥中RIO家族所有成员；
2. 基因复制事件和系统发育分析。通过分析ZmRIO家族和AtRIO家族的基因复制事件和系统发育关系，明确该家族的进化历史与机制；
3. 基因表达模式分析。通过EST和RNAseq数据分析，明确ZmRIO基因和AtRIO基因在不同组织器官中的表达模式。
3. 参考文献
[1] LaRonde-LeBlanc N, Wlodawer A. A family portrait of the RIO kinases [J]. J. Biol. Chem., 2005, 280: 37297-37300.
[2] Manning G, Whyte D B, Martinez R, Hunter T, Sudarsanam S. The protein kinase complement of the human genome [J]. Science, 2002, 298: 19121934.
[3] Esser D,Siebers B. Atypical protein kinases of the RIO family in archaea [J]. Biochem. Soc. T., 2013, 41: 399-404.
4. 毕业设计（论文）计划
2022年11月-2022年12月，查阅相关文献，熟悉各种生物信息学数据库和软件；
2022年1月-2022年3月，完善技术路线，开展各种分析；
2022年4月-2022年5月，分析和整理实验结果，撰写论文。
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