数据库挖掘新型单胺氧化酶-N及其分析模拟任务书

 2021-10-21 17:19:49

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

本次研究旨在通过数据库挖掘新型单胺氧化酶-N及其分析模拟,主要的实验内容:1、将单胺氧化酶-N模板放进大数据库中blast,找出blast结果中已经有结构特性的酶建成已知酶库和未知酶库。

2、已知酶库导进MEME-suit中进行特征基序分析。

3、根据特征基序,来源性,保守性对未知酶库进行筛选找到新酶。

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2. 参考文献

1.Ramesh H, Zajkoska P, Rebrosˇ M, Woodley JM (2016) The effect of cultivation media and washing whole-cell bio- catalysts on monoamine oxidase catalyzed oxidative desymmetrization of 3-azabicyclo[3,3,0]octane. Enz Microb Technol 83:7132.Rios-Solis L, Mothia B, Yi S, Zhou Y, Micheletti M, Lye GJ (2015) High throughput screening of monoamine oxidase (MAO-N-D5) substrate selectivity and rapid kinetic model generation. J Mol Cat B 120:1001103.Schilling B, Lerch K (1995) Amine oxidases from Aspergillus niger: identification of a novel flavin-dependent enzyme. Biochim Biophys Acta 1243:5295374.Weis R, Luiten R, Skranc W, Schwab H, Wubbolts M, Glieder A (2004) Reliable high-throughput screening with Pichia pastoris by limiting yeast cell death phenomena. FEMS Yeast Res 5:1791895.Zajkoska P, Rosenberg M, Heath R, Malone KJ, Stloukal R, Turner NJ, Rebrosˇ M (2015) Immobilised whole-cell recombinant monoamine oxidase biocatalysis. Appl Microbiol Biotechnol 99:12291236

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