1. 毕业设计(论文)的内容、要求、设计方案、规划等
大量阅读生物信息学方面的资料,了解该领域的发展现状。
下载杨树、拟南芥、柳树的基因组、基因、蛋白质等数据,熟悉这些数据的格式,及其常用数据处理方法,熟悉共线性等概念,熟悉blast、MCScanX等工具软件,网上下载多个物种的Motif资料,通过设计算法,预测出柳树的Motif。
2. 参考文献(不低于12篇)
刘沅;郑新娟;姜毅;孙远东;罗野婯;谭树华;金元昌;严明理;袁志栋,基于BLAST与比较基因组学方法计算鉴定青鳉鱼的microRNA前体,基因组学与应用生物学Kasuga, H., et al. (2013) The microRNA miR-235 couples blast-cell quiescence to the nutritional state, Nature, 497, 503-506.Balakathiresan, N., et al. (2012) MicroRNA let-7i is a promising serum biomarker for blast-induced traumatic brain injury, Journal of neurotrauma, 29, 1379-1387.徐坚,陈先知,王燕,史建磊,朱隆静,黄瓜、甜瓜和西瓜mlo基因家族的比较基因组学分析,核农学报芸薹属物种基因组进化及比较基因组学研究进展作者:周灿,付东辉,周庆红刊名:基因组学与应用生物学余知和,曾昭清,基于比较基因组学方法的丝状子囊菌同源序列分析,菌物学报,2013Altschul SF,Madden TL,Schaffer AA. Gapped BLAST and PSI-BLAST:a new generation of protein database search programs[J].Nucleic Acids Research,1997.3389-3402. Thompson JD,Higgins DG,Gibson TJ. CLUSTAL W:improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting,position-specific gap penalties and weight matrix choice[J].Nucleic Acids Research,1994.4673-4680. Yang Z. PAML:a program package for phylogenetic analysis by maximum likelihood[J].Computer Applications in the Biosciences:CABIOS,1997.555-556.刘娜,郭云波,孙显赫,马骊,邓亲恺,比较基因组学平台的设计与实现,南方医科大学学报,2010
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