1. 毕业设计(论文)主要内容:
目标简介:
全基因组关联分析(Genome-wide association study)是指在人类全基因组范围内找出存在的序列变异,即单核苷酸多态性(SNP),从中筛选出与疾病相关的SNPs。2005年,Science杂志报道了第一项具有年龄相关性的黄斑变性GWAS研究。之后陆续出现了有关冠心病、肥胖、2型糖尿病、精神分裂症以及相关表型的报道。GWAS为人们打开了一扇通往研究复杂疾病的大门,将在患者全基因组范围内检测出的SNP位点与对照组进行比较,找出所有的变异等位基因频率,从而避免了像候选基因策略一样需要预先假设致病基因。同时,GWAS研究让我们找到了许多从前未曾发现的基因以及染色体区域,为复杂疾病的发病机制提供了更多的线索。然而GWAS研究也存在一些问题:人群混杂(Population Stratification)是在大样本研究中导致假阳性、假阴性结果出现的重要原因之一,解释基因-变异-环境因素之间的相互作用关系需要使用GWAS对更多微效的与疾病关联的基因变异进行研究。本研究的目标就是提高现有GWAS算法对微效基因的检测能力。
2. 毕业设计(论文)主要任务及要求
1. 查阅15篇相关文献(含近五年外文3篇),并每篇书写200—300字文献摘要(装订成册,带封面);2.认真填写周记,完成800字开题报告;3.完成5000中文字以上的相关英文专业文献翻译,并装订成册(中英文一起,带封面);4.完成系统的编码与调试;5.完成10000字以上的毕业论文;6.进行论文答辩。
3. 毕业设计(论文)完成任务的计划与安排
(1)2016/1/11—2016/1/22:查阅参考文献,明确选题;(2)2016/1/23—2016/3/7:进一步阅读文献,并分析和总结;确定技术路线,完成并提交开题报告;(3)2016/3/8—2016/4/26:需求分析,算法或系统设计,分析、比较或实现等;(4)2016/4/27—2016/5/27:撰写论文初稿;修改论文,定稿并提交论文评审;(5)2016/5/28—2016/6/7:准备论文答辩。
4. 主要参考文献
[1] Klein RJ, Zeiss C, Chew EY,ect. Complementfactor H polymorphism in age-related macular degeneration. Science, 2005,308(5720): 385389.
[2] SamaniNJ, Erdmann J, Hall AS, ect. Genomewide associationanalysis of coronary arterydisease. N Engl J Med, 2007,357(5): 443453.
[3]Herbert A, Gerry NP, McQueen MB, ect. A common geneticvariant is associatedwith adult and childhood obesity.Science, 2006, 312(5771): 279283.
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