1. 毕业设计(论文)主要内容:
如今对mRNA 的可变剪切的研究主要集中于其运作的机理,对其在不同肿瘤的特异性表达很少有研究。本研究项目旨在利用癌症基因组图谱研究数据库提供的肾癌的测序数据,利用统计学和机器学习等各种手段,找出各个肿瘤特异性表达的mRNA 可变剪切。进一步,基于肿瘤特异性表达的可变剪切,识别可以作为生物标记物来区分正常和癌症样本的癌症特异性表达的mRNA可变剪切。
2. 毕业设计(论文)主要任务及要求
(1)熟悉基本的生物概念,以便更好的理解生物过程;
(2)熟悉高通量测序数据的格式和基本操作,要求会R语言或matlab编程;
(3)利用合适的统计学的方法来处理和分析数据,寻找肿瘤特异性表达的mRNA 可变剪切;
3. 毕业设计(论文)完成任务的计划与安排
(1)2017.2.10-2017.3.1文献阅读
(2)2017.3.5提交开题报告
(3)2017.3.6-2017.3.31学习生物概念和熟悉生物数据
(4)2017.4.1-2017.4.28处理数据,得到结果
(5)2017.4.29-2017.5.11整理结果,完成论文
(6)2017.5.12提交论文
4. 主要参考文献
癌症与可变剪接;
肿瘤基因信使rna可变剪接及其应用;
Brett, D., H. Pospisil, J. Valcarcel, J. Reich and P. Bork(2002). "Alternative splicing and genome complexity." Nat Genet 30(1): 29-30.
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