荧光假单胞菌GcM5-1A基因组内歧义序列测序分析任务书

 2022-08-30 09:43:47

1. 1. 毕业设计(论文)的内容、要求、设计方案、规划等

一、前言及要求

荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens) GcM5-1A是一种生活在松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)体表surface coat proteins中的一种革兰氏阴性菌,现已被确定对黑松具有致萎蔫作用,其全基因组测序工作已完成。

在G=cM5-1A的基因组内,我们发现了一个非常特殊的DNA大片段,此片段与假单胞菌噬菌体(Pseudomonas Phage)具有很高的同源性,并且是一个相对于整个基因组独立的存在,为了确定此片段的真实性,现决定进行针对此大片段的克隆转化测序分析,用以确定此大片段到底是全基因组测序过程中的污染还是GcM5-1A基因组内整个的内生噬菌体。

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2. 参考文献(不低于12篇)

1. 张成岗,贺福初. 生物信息学方法与实践[M]. 北京: 科学出版社, 2002, 64- 66.

2. 林万明著. PCR 技术操作与应用指南[M]. 北京: 人民军医出版社, 1993.

3. 郑仲承. 寡核苷酸的优化设计[J].生命的化学, 2001, 21( 3):254-256.

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